RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 TM9SF3Q9HD45 589 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 BICDL2A1A5D9 508 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 FSBPO95073 299 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 STX17P56962 302 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 NNTQ13423 1086 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 MORC3Q14149 939 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 LAYNQ6UX15 382 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 DBX2Q6ZNG2 339 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 TAC4Q86UU9 113 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 MRGPRX3Q96LB0 322 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 SGK2Q9HBY8 427 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 OSGEPQ9NPF4 335 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 SNX11Q9Y5W9 270 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 BIN1O00499 593 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 SIN3BO75182 1162 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 ASLP04424 464 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 CAPNS1P04632 268 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 KRT5P13647 590 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 GRIA4P48058 902 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 ST8SIA6P61647 398 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDH18Q13634 790 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 TEAD4Q15561 434 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 FSCBQ5H9T9 825 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 CFAP52Q8N1V2 620 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 NBEAQ8NFP9 2946 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 TAF4O00268 1085 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 FLRT2O43155 660 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 CD27P26842 260 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACADSBP45954 432 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 MARSP56192 900 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 BECN1Q14457 450 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 DCAF6Q58WW2 860 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 PITRM1Q5JRX3 1037 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 RHBDD1Q8TEB9 315 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 ORAI3Q9BRQ5 295 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 SERGEFQ9UGK8 458 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 BTBD3Q9Y2F9 522 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-208ENST00000616074 CAPN9O14815 690 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 GNA14O95837 355 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 IGHV4-34P06331 123 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 SCAPQ12770 1279 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 PAK1Q13153 545 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP30Q70CQ3 517 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 BEND5Q7L4P6 421 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 PROSER1Q86XN7 944 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 GANCQ8TET4 914 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC4A5Q9BY07 1137 aa21.51■■□□□ 1.03
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TRAPPC3-208ENST00000616074 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 SCML1Q9UN30 329 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 ERVW-1Q9UQF0 538 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 TTC34A8MYJ7 566 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 E5RJQ4 531 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 KCNK3O14649 394 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARID5BQ14865 1188 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 MEA1Q16626 185 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAP1GAP2Q684P5 730 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIAA0895LQ68EN5 471 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 LGI2Q8N0V4 545 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 KDM1BQ8NB78 822 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 STK32AQ8WU08 396 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACP6Q9NPH0 428 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 ITPR1Q14643 2758 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-208ENST00000616074 A0A1W2PP55 124 aa21.49■■□□□ 1.03
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