RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	MEI4	A8MW99	385 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	TGDS	O95455	350 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	BPGM	P07738	259 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	TPSB2	P20231	275 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	PGM1	P36871	562 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	PGGT1B	P53609	377 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	MFSD10	Q14728	455 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	TLK2	Q86UE8	772 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	TEX9	Q8N6V9	391 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	DERA	Q9Y315	318 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	DGKI	O75912	1065 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	IMPDH2	P12268	514 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	MAGEA6	P43360	314 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	ACADSB	P45954	432 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	PACS1	Q6VY07	963 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	CDKL2	Q92772	493 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	HSFY1	Q96LI6	401 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	USP3	Q9Y6I4	520 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	CTSH	P09668	335 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	NCAM1	P13591	858 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	NPR3	P17342	541 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	TPH1	P17752	444 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	TYK2	P29597	1187 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	OCRL	Q01968	901 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	STRADA	Q7RTN6	431 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	LPP	Q93052	612 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	MOCOS	Q96EN8	888 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341		E7ENQ6	273 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	CRHR1	P34998	444 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	ARHGAP8	P85298	464 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	CCL14	Q16627	93 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	SV2C	Q496J9	727 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	MTBP	Q96DY7	904 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	OLFM3	Q96PB7	478 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	THTPA	Q9BU02	230 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	WFS1	O76024	890 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	ERCC2	P18074	760 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	GNAZ	P19086	355 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	MUM1	Q2TAK8	710 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	TEX44	Q53QW1	395 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	FDFT1	P37268	417 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	CCNF	P41002	786 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	SERPINB9	P50453	376 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	GRB14	Q14449	540 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SMTN-222	ENST00000612341	USP33	Q8TEY7	942 aa		13.23	□□□□□ -0.29

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