RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 UCMAQ8WVF2 138 aa20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 HSFY1Q96LI6 401 aa20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 ACOX2Q99424 681 aa20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 NUP58Q9BVL2 599 aa20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 ST7Q9NRC1 585 aa20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 MARK1Q9P0L2 795 aa20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 RAD54BQ9Y620 910 aa20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 YJEFN3A6XGL0 299 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 E7ENQ6 273 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 DFNA5O60443 496 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 GABBR2O75899 941 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 HMBSP08397 361 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 ACADMP11310 421 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 TYRP14679 529 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 GPD2P43304 727 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 COG7P83436 770 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 KCNMA1Q12791 1236 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 KRT31Q15323 416 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 PTPRNQ16849 979 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 BSPRYQ5W0U4 402 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 GPR155Q7Z3F1 870 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 SCML4Q8N228 414 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF843Q8N446 348 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 RNF139Q8WU17 664 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 EDEM1Q92611 657 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 MIS12Q9H081 205 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 FTSJ1Q9UET6 329 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 HCN2Q9UL51 889 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 SLC12A8A0AV02 714 aa19.99■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 FAM149AA5PLN7 773 aa19.99■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 PCDHGA12O60330 932 aa19.99■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 GREM1O60565 184 aa19.99■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 STC2O76061 302 aa19.99■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 RAPGEF1Q13905 1077 aa19.99■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 IRGQQ8WZA9 623 aa19.99■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 IGSF8Q969P0 613 aa19.99■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 SIPA1Q96FS4 1042 aa19.99■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 OSGEPQ9NPF4 335 aa19.99■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 ABCC13Q9NSE7 274 aa19.99■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF462Q96JM2 2506 aa19.99■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 FBXO21O94952 628 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 IGLV3-19P01714 112 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 TPMTP51580 245 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 CFHR1Q03591 330 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 PTK2Q05397 1052 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 MEA1Q16626 185 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 CLEC4CQ8WTT0 213 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 GOLGA1Q92805 767 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 FHOD1Q9Y613 1164 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 STON1Q9Y6Q2 735 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 KALRNO60229 2985 aa19.98■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 BPTFQ12830 3046 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 A0A1B0GVT2 93 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 PLK4O00444 970 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 C1SP09871 688 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 JUPP14923 745 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 ACADSBP45954 432 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 GRIA4P48058 902 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 FUT11Q495W5 492 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 ANO6Q4KMQ2 910 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC157Q569K6 752 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 FKBP15Q5T1M5 1219 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 DHRS13Q6UX07 377 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 Q6ZNB5 142 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 TPGS1Q6ZTW0 290 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 FMNL3Q8IVF7 1028 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 AOPEPQ8N6M6 819 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 DCLK3Q9C098 648 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 NRSN2Q9GZP1 204 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 SLC6A17Q9H1V8 727 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 CD93Q9NPY3 652 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF510Q9Y2H8 683 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 AK5Q9Y6K8 562 aa19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 PRRT4C9JH25 899 aa19.96■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 ERVH48-1M5A8F1 160 aa19.96■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 LTFP02788 710 aa19.96■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 KLKB1P03952 638 aa19.96■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 UCHL3P15374 230 aa19.96■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 ITPKBP27987 946 aa19.96■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 CLCN1P35523 988 aa19.96■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 COPB1P53618 953 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SGMS1-208ENST00000608287 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms