RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 DMWDQ09019 674 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 ANGPT1Q15389 498 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB41Q5JT25 222 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 DTWD2Q8NBA8 298 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 KLF15Q9UIH9 416 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 OLFM2O95897 454 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC7A9P82251 487 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 SKOR1P84550 965 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 GUCY1A3Q02108 690 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 PPARDQ03181 441 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 DHCR24Q15392 516 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS6KA1Q15418 735 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 FMNL3Q8IVF7 1028 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC33Q8N5R6 958 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 PDZD8Q8NEN9 1154 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 SHDQ96IW2 340 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 SYNCQ9H7C4 482 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CLEC4EQ9ULY5 219 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 F8VZ95 297 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 STC2O76061 302 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP11B1P15538 503 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CLCN5P51795 746 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 DAOAP59103 153 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 FSTL4Q6MZW2 842 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 RFWD3Q6PCD5 774 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 MAATS1Q7Z4T9 603 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CYLDQ9NQC7 956 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLGA8SH3BPF8 625 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 FYNP06241 537 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CHRNB1P11230 501 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC39CQ8N584 583 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF139Q8WU17 664 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 DNMT3LQ9UJW3 386 aa12.98□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 TMCO5BA8MYB1 307 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP104O60308 925 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 ERBB2P04626 1255 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 RALAP11233 206 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 NHLH1Q02575 133 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 IFT88Q13099 833 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPN20Q4JDL3 420 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 OR6B2Q6IFH4 312 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CACUL1Q86Y37 369 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM71AQ8IYT1 594 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 DNASE1L2Q92874 299 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP2A3Q93084 1043 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 E2F7Q96AV8 911 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 MYEOVQ96EZ4 313 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 AP1M1Q9BXS5 423 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM107BQ9H098 131 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CENPHQ9H3R5 247 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 INVSQ9Y283 1065 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 GREM1O60565 184 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 SETSIPP0DME0 302 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 NR1D1P20393 614 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 PRKCQQ04759 706 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 GAB4Q2WGN9 574 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB6CQ53S08 254 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP85LQ5SZL2 805 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 NAA35Q5VZE5 725 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf210Q8IVY1 113 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 MREGQ8N565 214 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 BBS2Q9BXC9 721 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB6CQ9H0N0 254 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CNTN6Q9UQ52 1028 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 PLAAQ9Y263 795 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCA7Q8IZY2 2146 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 LTFP02788 710 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 OPRD1P41143 372 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 SGSHP51688 502 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 DCAF6Q58WW2 860 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 P2RY13Q9BPV8 354 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAI2Q9GZS0 605 aa12.96□□□□□ -0.33
RABGEF1-209ENST00000607882 MIA3Q5JRA6 1907 aa12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms