RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RAPGEF5Q92565 580 aa20.17■□□□□ 0.82
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 F5P12259 2224 aa20.17■□□□□ 0.82
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.16■□□□□ 0.82
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PSTPIP1O43586 416 aa20.16■□□□□ 0.82
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GOT1P17174 413 aa20.16■□□□□ 0.82
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARSEP51690 589 aa20.16■□□□□ 0.82
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCTD6Q8NC69 237 aa20.16■□□□□ 0.82
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.16■□□□□ 0.82
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.14■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.14■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CACNG3O60359 315 aa20.14■□□□□ 0.81
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 IL4RP24394 825 aa20.14■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CTNNA2P26232 953 aa20.14■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HOXC13P31276 330 aa20.14■□□□□ 0.81
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 DPYSL3Q14195 570 aa20.14■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.14■□□□□ 0.81
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.13■□□□□ 0.81
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDH4P55283 916 aa20.13■□□□□ 0.81
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 TSC1Q92574 1164 aa20.13■□□□□ 0.81
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.13■□□□□ 0.81
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 SHISA7A6NL88 538 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 H0Y626 953 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARL4AP40617 200 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PDK2Q15119 407 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.13■□□□□ 0.81
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 NLRP14Q86W24 1093 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC35F6Q8N357 371 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WNT16Q9UBV4 365 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FBXO10Q9UK96 956 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TTC28Q96AY4 2481 aa20.13■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NUP205Q92621 2012 aa20.12■□□□□ 0.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.12■□□□□ 0.81
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