RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583841.1

TSPOAP1-AS1-210, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1-AS1, Length 840 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BDP1A6H8Y1 2624 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCDC66A2RUB6 948 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 H3BRJ5 948 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CNTN5O94779 1100 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TYRP14679 529 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EPHB2P29323 1055 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SOX9P48436 509 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARSEP51690 589 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GAD2Q05329 585 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NR1H3Q13133 447 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MMRN1Q13201 1228 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ALFQ53S48 1182 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FYB2Q5VWT5 728 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KATNAL2Q8IYT4 538 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC35F6Q8N357 371 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ALG3Q92685 438 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DNASE1L2Q92874 299 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HES6Q96HZ4 224 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZYG11BQ9C0D3 744 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa16.18■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DRGXA6NNA5 263 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DAPK3O43293 454 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KDELR1P24390 212 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARL4AP40617 200 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GNG11P61952 73 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PFKPQ01813 784 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DPYSL3Q14195 570 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PDK2Q15119 407 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RPS6KA1Q15418 735 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C5orf22Q49AR2 442 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAP7D3Q8IWC1 876 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UBL4BQ8N7F7 174 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NAT16Q8N8M0 369 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAM71BQ8TC56 605 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRPV5Q9NQA5 729 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MUTYHQ9UIF7 546 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NUP205Q92621 2012 aa16.17■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 A0A1B0GVM2 712 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ENC1O14682 589 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HOXC13P31276 330 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HTR7P34969 479 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GJA4P35212 333 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PEX5P50542 639 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RWDD2BP57060 319 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GAB4Q2WGN9 574 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MPP7Q5T2T1 576 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IER5LQ5T953 404 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RFX8Q6ZV50 586 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C12orf40Q86WS4 652 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TSC1Q92574 1164 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CLEC4EQ9ULY5 219 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 JRKLQ9Y4A0 524 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PIAS3Q9Y6X2 628 aa16.16■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CHD5Q8TDI0 1954 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 H0Y626 953 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CACNG3O60359 315 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CLDN11O75508 207 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RHOQP17081 205 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IL4RP24394 825 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CDH4P55283 916 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CDH18Q13634 790 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DPYSQ14117 519 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LLGL1Q15334 1064 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MFSD7Q6UXD7 560 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CHST9Q7L1S5 443 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NLRP14Q86W24 1093 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MFN1Q8IWA4 741 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.15■□□□□ 0.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EXD1Q8NHP7 514 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms