RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559276.5

USP3-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 4

Gene USP3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-212ENST00000559276 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 CCDC188H7C350 402 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 MDM4O15151 490 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 CYP26A1O43174 497 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 CACNG3O60359 315 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 EXOC3O60645 756 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SRGAP2O75044 1071 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 AP1G2O75843 785 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 GFPT2O94808 682 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 ADH1CP00326 375 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 KLKB1P03952 638 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SERPING1P05155 500 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 MYBL2P10244 700 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 ENGP17813 658 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 NDUFV2P19404 249 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SLC8A1P32418 973 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 MYH10P35580 1976 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 PI4KAP42356 2102 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 WASP42768 502 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 MAGEA1P43355 309 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 LIG3P49916 1009 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 NDST1P52848 882 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 GAD2Q05329 585 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 FOXC1Q12948 553 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SEMA3BQ13214 749 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 TRPC3Q13507 836 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 NCOA4Q13772 614 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SLMAPQ14BN4 828 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 ZNF699Q32M78 642 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 TTMPQ5BVD1 217 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 EOGTQ5NDL2 527 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 NAA35Q5VZE5 725 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 Q6ZNB5 142 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 HTR3DQ70Z44 454 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SV2AQ7L0J3 742 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SCD5Q86SK9 330 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 C11orf74Q86VG3 221 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 TTC30AQ86WT1 665 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SYT12Q8IV01 421 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 DEFB119Q8N690 84 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.12□□□□□ -1.43
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USP3-212ENST00000559276 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 OTUB2Q96DC9 234 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 PBKQ96KB5 322 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 GABRG3Q99928 467 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 TLR10Q9BXR5 811 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 CYLDQ9NQC7 956 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 KRT82Q9NSB4 513 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 COMMD8Q9NX08 183 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 MARK1Q9P0L2 795 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 FBXO10Q9UK96 956 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 IGF2RP11717 2491 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 C5orf60A6NFR6 353 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 WASH3PC4AMC7 463 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 ZNF185O15231 689 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 TLR5O60602 858 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 GJB3O75712 270 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 ALDH1A2O94788 518 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 GSTA1P08263 222 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 MYZAPP0CAP1 466 aa6.11□□□□□ -1.43
USP3-212ENST00000559276 IRF1P10914 325 aa6.11□□□□□ -1.43
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