RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	PSMD5	Q16401	504 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	DUSP6	Q16828	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	UPP1	Q16831	310 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CD302	Q8IX05	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CASP10	Q92851	521 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TSG101	Q99816	390 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ZBP1	Q9H171	429 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	RMND1	Q9NWS8	449 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SZT2	Q5T011	3432 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	OBSL1	O75147	1896 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	REV3L	O60673	3130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPRD	P23468	1912 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CBX4	O00257	560 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CYB561D2	O14569	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PPEF2	O14830	753 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CCL16	O15467	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TEX28	O15482	410 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	HUS1	O60921	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GLUD1	P00367	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PIGR	P01833	764 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	NR3C1	P04150	777 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ITGB3	P05106	788 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MYL1	P05976	194 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT13	P13646	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	IL9	P15248	144 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	THBS2	P35442	1172 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PRCP	P42785	496 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	GLRB	P48167	497 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	STX17	P56962	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	UBE2H	P62256	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	RBP5	P82980	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	IRF9	Q00978	393 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PFKP	Q01813	784 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	DSG1	Q02413	1049 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SURF1	Q15526	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	NAB2	Q15742	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TAF12	Q16514	161 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-238	ENST00000556288	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61

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