RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876		A0A1B0GVC2	190 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	SEPT4	O43236	478 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	MT-CO3	P00414	261 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	CYP21A2	P08686	494 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	PEPD	P12955	493 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TLE3	Q04726	772 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	UBE3A	Q05086	875 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	PIGS	Q96S52	555 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBM23-208	ENST00000553876	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876		E5RJQ4	531 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	EYA2	O00167	538 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	STX16	O14662	325 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	FYB1	O15117	783 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	GCAT	O75600	419 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CYP3A4	P08684	503 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	PCP4	P48539	62 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	RCAN1	P53805	252 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	FOXL2	P58012	376 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TAS2R50	P59544	299 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TLE2	Q04725	743 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876		Q4G0T1	1027 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	MAF1	Q9H063	256 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CLIC1	O00299	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	XBP1	P17861	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SLC8A1	P32418	973 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CHRND	Q07001	517 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TRPC3	Q13507	836 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CNGA3	Q16281	694 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ESX1	Q8N693	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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