RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 KRT37O76014 449 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 DNTTP04053 509 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 ASLP04424 464 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 ST8SIA6P61647 398 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 FAM193AP78312 1265 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 BNC1Q01954 994 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 PTK2Q05397 1052 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 GRIK2Q13002 908 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SLC14A1Q13336 389 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 MIIPQ5JXC2 388 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 PASD1Q8IV76 773 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 KDM1BQ8NB78 822 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 NDST4Q9H3R1 872 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 NUMA1Q14980 2115 aa14.98□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 H0Y626 953 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SIN3BO75182 1162 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SPINK2P20155 84 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 CDK17Q00537 523 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 KCNMA1Q12791 1236 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 CDH18Q13634 790 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 ARID5BQ14865 1188 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 VWA3BQ502W6 1294 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 CHSY1Q86X52 802 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 APCDD1Q8J025 514 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 CACNA1EQ15878 2313 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 F5H5T6 163 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SH3BP5O60239 455 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 HSF2BPO75031 334 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 GRAP2O75791 330 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 MOCS3O95396 460 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SEMA4FO95754 770 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 ERBB2P04626 1255 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 KRT9P35527 623 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SLC6A3Q01959 620 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SGK2Q9HBY8 427 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SCML1Q9UN30 329 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.96□□□□□ -0.01
CS-229ENST00000551936 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 TTC34A8MYJ7 566 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 C1QTNF9P0C862 333 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 SLC2A3P11169 496 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 ABCB4P21439 1286 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 CCR1P32246 355 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 ECT2LQ008S8 904 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 SLC12A1Q13621 1099 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 USP30Q70CQ3 517 aa14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CS-229ENST00000551936 PTPRN2Q92932 1015 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms