RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLDN10	P78369	228 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	STAT4	Q14765	748 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	COLEC12	Q5KU26	742 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	KDM1B	Q8NB78	822 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	FLNC	Q14315	2725 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	MYLK	Q15746	1914 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SDC3	O75056	442 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	VNN1	O95497	513 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADH1B	P00325	375 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	GP1BA	P07359	652 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ALPPL2	P10696	532 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CKMT1A	P12532	417 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	C5AR1	P21730	350 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ASPA	P45381	313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	INCA1	Q0VD86	236 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	PDILT	Q8N807	584 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	OR4C6	Q8NH72	309 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	RNF139	Q8WU17	664 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRIM4	Q9C037	500 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	MTG2	Q9H4K7	406 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SEPT3	Q9UH03	358 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	DMTF1	Q9Y222	760 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	LRRK2	Q5S007	2527 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	NOTCH2	Q04721	2471 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	IRAK2	O43187	625 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	LAT	O43561	262 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBL1X	O60907	577 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZBED1	O96006	694 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SFTPC	P11686	197 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CD70	P32970	193 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	PSMD8	P48556	350 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADPRH	P54922	357 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	INHBC	P55103	352 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	EHHADH	Q08426	723 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZACN	Q401N2	412 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMC6	Q7Z403	805 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC25A45	Q8N413	288 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMX3	Q96JJ7	454 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	TWNK	Q96RR1	684 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CUEDC2	Q9H467	287 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	USP29	Q9HBJ7	922 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691		A0A1B0GVM2	712 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	NEMP2	A6NFY4	417 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	IKBKB	O14920	756 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	MOCS3	O95396	460 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRT10	P13645	584 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CD58	P19256	250 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	DGKA	P23743	735 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TXNRD1-223	ENST00000531691	CSK	P41240	450 aa		11.59	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms