RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529417.1

AP001999.2-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AP001999.2, Length 389 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP001999.2-201ENST00000529417 CDC16Q13042 620 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 PDCLQ13371 301 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 ATP1A4Q13733 1029 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 GRM4Q14833 912 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 IQCB1Q15051 598 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SEC23BQ15437 767 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 NFIL3Q16649 462 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 MSMPQ1L6U9 139 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 TRIM60Q495X7 471 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 MFSD14BQ5SR56 506 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 ANO7Q6IWH7 933 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 KRT74Q7RTS7 529 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 ZSCAN30Q86W11 494 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 TAGAPQ8N103 731 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 ANKRD44Q8N8A2 993 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 TBC1D5Q92609 795 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 CEP95Q96GE4 821 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 CALML4Q96GE6 196 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 MED15Q96RN5 788 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 TTPALQ9BTX7 342 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 TXLNGYQ9BZA5 131 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 TTYH3Q9C0H2 523 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 NYXQ9GZU5 481 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 KATNBL1Q9H079 304 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 GSTO2Q9H4Y5 243 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 VEZTQ9HBM0 779 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 BAG5Q9UL15 447 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 NFU1Q9UMS0 254 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SHOC2Q9UQ13 582 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SNX8Q9Y5X2 465 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 PHIPQ8WWQ0 1821 aa4.55□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 ZNF536O15090 1300 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SH3TC1Q8TE82 1336 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 NUP98P52948 1817 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 FAM90A16PA6NEW6 464 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 H3BNC9 293 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 H7C0S8 307 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SEPT4O43236 478 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 VPS4BO75351 444 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 AGFG2O95081 481 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 POMCP01189 267 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 FAM90A15PP0C7V4 464 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 FAM90A14PP0C7W9 464 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 TGM1P22735 817 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SLC6A4P31645 630 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 GZMKP49863 264 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 BPIFB4P59827 614 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 MC1RQ01726 317 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 CREB5Q02930 508 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 CSHL1Q14406 222 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 BECN1Q14457 450 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 PCOLCEQ15113 449 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 RASA2Q15283 850 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 ZNF750Q32MQ0 723 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 GALNTL6Q49A17 601 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 C1orf141Q5JVX7 400 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 TRIM68Q6AZZ1 485 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 MFSD5Q6N075 450 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 LAYNQ6UX15 382 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 VSIG1Q86XK7 387 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 FLCNQ8NFG4 579 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SLC46A1Q96NT5 459 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SYT3Q9BQG1 590 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 MESP1Q9BRJ9 268 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 MXD3Q9BW11 206 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SIL1Q9H173 461 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SLC6A17Q9H1V8 727 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 ZWILCHQ9H900 591 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 HESX1Q9UBX0 185 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 PCDHGB4Q9UN71 923 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.54□□□□□ -1.68
AP001999.2-201ENST00000529417 LRRC37AA6NMS7 1700 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms