RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
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PTPRJ-205ENST00000527952 CD27P26842 260 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-205ENST00000527952 STIM1Q13586 685 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-205ENST00000527952 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-205ENST00000527952 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa24.92■■□□□ 1.58
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PTPRJ-205ENST00000527952 TTC17Q96AE7 1141 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRJ-205ENST00000527952 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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PTPRJ-205ENST00000527952 SLC6A18Q96N87 628 aa24.9■■□□□ 1.58
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PTPRJ-205ENST00000527952 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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PTPRJ-205ENST00000527952 TLR6Q9Y2C9 796 aa24.89■■□□□ 1.58
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PTPRJ-205ENST00000527952 PMM2O15305 246 aa24.88■■□□□ 1.57
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PTPRJ-205ENST00000527952 CCT8P50990 548 aa24.88■■□□□ 1.57
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PTPRJ-205ENST00000527952 CETN1Q12798 172 aa24.88■■□□□ 1.57
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PTPRJ-205ENST00000527952 ACP6Q9NPH0 428 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRJ-205ENST00000527952 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRJ-205ENST00000527952 CEP83Q9Y592 693 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRJ-205ENST00000527952 NBEAQ8NFP9 2946 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRJ-205ENST00000527952 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-205ENST00000527952 BAHCC1Q9P281 2608 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-205ENST00000527952 CAPN9O14815 690 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-205ENST00000527952 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRJ-205ENST00000527952 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
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