RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527157.1

KDM2A-208, Transcript of lysine demethylase 2A, human

TSL 2

Gene KDM2A, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM2A-208	ENST00000527157	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	CDSN	Q15517	529 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	EOGT	Q5NDL2	527 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SLC22A12	Q96S37	553 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SPON2	Q9BUD6	331 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	OBSL1	O75147	1896 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	THADA	Q6YHU6	1953 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	PLK4	O00444	970 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	DTNB	O60941	627 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	KAT7	O95251	611 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	PF4	P02776	101 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	CYP17A1	P05093	508 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	PGR	P06401	933 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	CSH1	P0DML2	217 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	CSH2	P0DML3	217 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	HLA-E	P13747	358 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	TNFSF9	P41273	254 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	NPTX2	P47972	431 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	EVC	P57679	992 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	KDSR	Q06136	332 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	REST	Q13127	1097 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	STK3	Q13188	491 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	CARF	Q8N187	725 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	PNKP	Q96T60	521 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	ANK1	P16157	1881 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	PTPRD	P23468	1912 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KDM2A-208	ENST00000527157	IGF2R	P11717	2491 aa		4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms