RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 NOX5Q96PH1 765 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 C11orf70Q9BRQ4 267 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 DESI2Q9BSY9 194 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SYNCQ9H7C4 482 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LRRC4Q9HBW1 653 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MYO1AQ9UBC5 1043 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TJP2Q9UDY2 1190 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 NAGPAQ9UK23 515 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAFFQ9ULX9 164 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
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MSC-AS1-205ENST00000519068 MTCH2Q9Y6C9 303 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 DUSP10Q9Y6W6 482 aa5.6□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 COL4A6Q14031 1691 aa5.59□□□□□ -1.51
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MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SIGLEC16A6NMB1 481 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC38A8A6NNN8 435 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GOLGA8SH3BPF8 625 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 H3BRJ5 948 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCL16O15467 120 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC01565O15544 149 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 BNIP3LO60238 219 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 DLX3O60479 287 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ULK1O75385 1050 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLEC3AO75596 197 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 RFPL2O75678 378 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LCA5LO95447 670 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LSM8O95777 96 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZBED1O96006 694 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERBB2P04626 1255 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTPN2P17706 415 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 NAT1P18440 290 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CD33P20138 364 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABCB4P21439 1286 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MMP8P22894 467 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 RRM1P23921 792 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 YWHAQP27348 245 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACADSBP45954 432 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GABRB2P47870 512 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPL34P49207 117 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PGFP49763 221 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 BCAT1P54687 386 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SNX16P57768 344 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 IL2P60568 153 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 NOMO3P69849 1222 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC6A3Q01959 620 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GSTM4Q03013 218 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 HYAL1Q12794 435 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAP4K2Q12851 820 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTP4A2Q12974 167 aa5.59□□□□□ -1.51
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MSC-AS1-205ENST00000519068 DUSP6Q16828 381 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTPN20Q4JDL3 420 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAB41Q5JT25 222 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PPM1LQ5SGD2 360 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 C10orf76Q5T2E6 689 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LIN9Q5TKA1 542 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PIK3R6Q5UE93 754 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PM20D1Q6GTS8 502 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANKRD42Q8N9B4 389 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 VN1R2Q8NFZ6 395 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 FEZF2Q8TBJ5 459 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 HDAC7Q8WUI4 952 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ATRIPQ8WXE1 791 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 KCTD13Q8WZ19 329 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 VCPIP1Q96JH7 1222 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPATA17Q96L03 361 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC140Q96MF4 163 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CPXM1Q96SM3 734 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 ULBP1Q9BZM6 244 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 IL37Q9NZH6 218 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 WHRNQ9P202 907 aa5.59□□□□□ -1.51
MSC-AS1-205ENST00000519068 HSFX1Q9UBD0 423 aa5.59□□□□□ -1.51
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