RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515564.5

GATB-212, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B, humanhuman

TSL 2

Gene GATB, Length 6,552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATB-212ENST00000515564 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.51□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 MTMR9Q96QG7 549 aa8.51□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 MANSC1Q9H8J5 431 aa8.51□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.51□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 KLHL3Q9UH77 587 aa8.51□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 NWD1Q149M9 1564 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 E9PBE3 544 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 KRT6AP02538 564 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 KRT6BP04259 564 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 CLTBP09497 229 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 TPBGLP0DKB5 382 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 JAK1P23458 1154 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 KRT6CP48668 564 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 P3H2Q8IVL5 708 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PPTC7Q8NI37 304 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 CENPTQ96BT3 561 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 MRGBPQ9NV56 204 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PRKAG3Q9UGI9 489 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 A0A087X0T9 212 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 CHN1P15882 459 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 POU1F1P28069 291 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 CDH17Q12864 832 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 NR6A1Q15406 480 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 NLRP14Q86W24 1093 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PLD3Q8IV08 490 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 RAD51CO43502 376 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 TOMM70O94826 608 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 NFATC1O95644 943 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 ZNF682O95780 498 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 NPY2RP49146 381 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 DUSP4Q13115 394 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 MPP3Q13368 585 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 SEC23AQ15436 765 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 ALG11Q2TAA5 492 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 ZNF606Q8WXB4 792 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 BPIFA1Q9NP55 256 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 SCN3BQ9NY72 215 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 GUCY1B2O75343 617 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 CFIP05156 583 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PAEPP09466 180 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 NPR3P17342 541 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 ABL2P42684 1182 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PKN1Q16512 942 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 CRY1Q16526 586 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 DEC1Q9P2X7 70 aa8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 MAGEB16A2A368 324 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 TMEM114B3SHH9 223 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 E5RJQ4 531 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 UQCRBP14927 111 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 BRCC3P46736 316 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 FGD2Q7Z6J4 655 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PARVBQ9HBI1 364 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 TAS2R13Q9NYV9 303 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 MPP6Q9NZW5 540 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 ZNF536O15090 1300 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 SNTNA6NMZ2 147 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 GRK2P25098 689 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 CD151P48509 253 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 TRIM32Q13049 653 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 GPM6BQ13491 265 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.49□□□□□ -1.05
GATB-212ENST00000515564 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.49□□□□□ -1.05
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