RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 HHATQ5VTY9 493 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.46□□□□□ -1.22
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SMIM20-202ENST00000514384 SV2AQ7L0J3 742 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.46□□□□□ -1.22
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SMIM20-202ENST00000514384 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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SMIM20-202ENST00000514384 CWH43Q9H720 699 aa7.45□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 MKS1Q9NXB0 559 aa7.45□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.45□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF212Q9UDV6 495 aa7.45□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.45□□□□□ -1.22
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