RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, humanhuman

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1-218ENST00000495588 THAP9Q9H5L6 903 aa5.94□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 GRPEL1Q9HAV7 217 aa5.94□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PTPRHQ9HD43 1115 aa5.94□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa5.94□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.94□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 STYXL1Q9Y6J8 313 aa5.94□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 UMODL1Q5DID0 1318 aa5.94□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 MROH7Q68CQ1 1323 aa5.94□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.94□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CEP350Q5VT06 3117 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CENPFP49454 3210 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 A0A1B0GUA9 196 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 GOLGA8IPA6NC78 632 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 GOLGA8JA6NMD2 632 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 KCNJ18B7U540 433 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CETN3O15182 167 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PCDHGA12O60330 932 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CAND2O75155 1236 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 RPS6KA5O75582 802 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 TOM1L1O75674 476 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 AKAP3O75969 853 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 ADRB2P07550 413 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 MYBL2P10244 700 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 GHRP10912 638 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 HARSP12081 509 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PROZP22891 400 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 TNFSF9P41273 254 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CASP4P49662 377 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 SCAND1P57086 179 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 TPM4P67936 248 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 TLE2Q04725 743 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 KCNJ12Q14500 433 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 MYBPC3Q14896 1274 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CCDC40Q4G0X9 1142 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 FBXO47Q5MNV8 452 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CATSPER4Q7RTX7 472 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CBWD2Q8IUF1 395 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CREBRFQ8IUR6 639 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 DTX3Q8N9I9 347 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 GOLGA5Q8TBA6 731 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CAGE1Q8TC20 777 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PDZD7Q9H5P4 517 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 DMAC2Q9NW81 257 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 TNFSF13BQ9Y275 285 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 TANC1Q9C0D5 1861 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 ALPK3Q96L96 1907 aa5.93□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 A0A0B4J269 797 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CLDN3O15551 220 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 FAM189A1O60320 539 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 EXOC3O60645 756 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 NBNO60934 754 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 SCGB1D2O95969 90 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 MT-CO1P00395 513 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CLTBP09497 229 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 EPB41P11171 864 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CAPN2P17655 700 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 AXLP30530 894 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 CD52P31358 61 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 MC4RP32245 332 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 MTNR1BP49286 362 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 ACOT2P49753 483 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 MRE11P49959 708 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PFKPQ01813 784 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 BFSP2Q13515 415 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 MYBPC2Q14324 1141 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 LPIN1Q14693 890 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 GPNMBQ14956 572 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 KRT31Q15323 416 aa5.92□□□□□ -1.46
GAPVD1-218ENST00000495588 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
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