RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 EPSTI1Q96J88 318 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 EBF2Q9HAK2 575 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 USP29Q9HBJ7 922 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 DMTF1Q9Y222 760 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 CREBBPQ92793 2442 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 PLXNA2O75051 1894 aa6.41□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 NEMP2A6NFY4 417 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 HHLA1C9JL84 531 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 TRIM38O00635 465 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 CLIC2O15247 247 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 EXOC3O60645 756 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 SIN3BO75182 1162 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 MOCS3O95396 460 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 GJB6O95452 261 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 IL1BP01584 269 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 SLFN14P0C7P3 912 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 GOT1P17174 413 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 C5AR1P21730 350 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 DGKAP23743 735 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 PPP2CBP62714 309 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 PPP2CAP67775 309 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 EHHADHQ08426 723 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 CDH18Q13634 790 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 ISXQ2M1V0 245 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 ADGRF1Q5T601 910 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 BRAPQ7Z569 592 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 SCD5Q86SK9 330 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 MFN1Q8IWA4 741 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 RNF139Q8WU17 664 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.4□□□□□ -1.38
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CBX1-205ENST00000495350 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 STARD5Q9NSY2 213 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.4□□□□□ -1.38
CBX1-205ENST00000495350 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.4□□□□□ -1.38
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CBX1-205ENST00000495350 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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CBX1-205ENST00000495350 WNT9AO14904 365 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 SUV39H1O43463 412 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 LATO43561 262 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 TBL1XO60907 577 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 PPFIA2O75334 1257 aa6.39□□□□□ -1.39
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CBX1-205ENST00000495350 FAM87AP0C7U9 286 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 CD70P32970 193 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 NNMTP40261 264 aa6.39□□□□□ -1.39
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CBX1-205ENST00000495350 SLC11A2P49281 568 aa6.39□□□□□ -1.39
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CBX1-205ENST00000495350 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 C4orf17Q53FE4 359 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 MPP7Q5T2T1 576 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 EXD3Q8N9H8 876 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 IFI44Q8TCB0 444 aa6.39□□□□□ -1.39
CBX1-205ENST00000495350 ZNF516Q92618 1163 aa6.39□□□□□ -1.39
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