RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DUSP2	Q05923	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RAB30	Q15771	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DOK3	Q7L591	496 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	APBB2	Q92870	758 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PCYT2	Q99447	389 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CDH19	Q9H159	772 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NRP1	O14786	923 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	B3GALT2	O43825	422 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NRP2	O60462	931 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	BMP15	O95972	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MYL1	P05976	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TPM3	P06753	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	LAG3	P18627	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CTSS	P25774	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62	9e-9	■■□□□ 13.9
RBM39-240	ENST00000495293	HOXC8	P31273	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TEC	P42680	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GZMK	P49863	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PRKCE	Q02156	737 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CUL4A	Q13619	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GJA10	Q969M2	543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CEP170P1	Q96L14	293 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ADAM2	Q99965	735 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	GINS2	Q9Y248	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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