RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486660.1

STX4-209, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-209ENST00000486660 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.66□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 PNPLA8Q9NP80 782 aa14.66□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 SATB2Q9UPW6 733 aa14.66□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 USP3Q9Y6I4 520 aa14.66□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 FFAR2O15552 330 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 SLC8A1P32418 973 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 PSMD8P48556 350 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 ADPRHP54922 357 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 SKOR1P84550 965 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 UNC93AQ86WB7 457 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 MFSD2AQ8NA29 543 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 PLD4Q96BZ4 506 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 FZD4Q9ULV1 537 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 CLIC4Q9Y696 253 aa14.65□□□□□ -0.06
STX4-209ENST00000486660 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 LATO43561 262 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 STAT6P42226 847 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 ASPAP45381 313 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 OR4C6Q8NH72 309 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 NBASA2RRP1 2371 aa14.64□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TTC34A8MYJ7 566 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 EFSO43281 561 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 CKMT1AP12532 417 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 DGKAP23743 735 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 CLN3Q13286 438 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 FAM129BQ96TA1 746 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 STARD5Q9NSY2 213 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 WDR70Q9NW82 654 aa14.63□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 SUV39H1O43463 412 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TBL1XO60907 577 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 GIMD1P0DJR0 217 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 P4HA1P13674 534 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 GOT1P17174 413 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TXLNAP40222 546 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 METAP1P53582 386 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 ST8SIA6P61647 398 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 DLG4P78352 724 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 ISXQ2M1V0 245 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 POM121L1PQ3SYA9 428 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 TTC17Q96AE7 1141 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 LMLNQ96KR4 655 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 APOLD1Q96LR9 279 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 DUSP16Q9BY84 665 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 ABCG4Q9H172 646 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
STX4-209ENST00000486660 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms