RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 LATS1O95835 1130 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 FYNP06241 537 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CEACAM1P13688 526 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 TACR2P21452 398 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PON1P27169 355 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ACSL1P33121 698 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 GGCXP38435 758 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 NNMTP40261 264 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 COPAP53621 1224 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 MS4A13Q5J8X5 152 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB106AQ8N104 65 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 FAM81BQ96LP2 452 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 OMDQ99983 421 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CLSTN2Q9H4D0 955 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 THAP9Q9H5L6 903 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PRSS16Q9NQE7 514 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 DACH1Q9UI36 760 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GVT2 93 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 METTL12A8MUP2 240 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 BECN2A8MW95 431 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 TTC34A8MYJ7 566 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 GOLGA8SH3BPF8 625 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 M0QYT0 321 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 KCNK3O14649 394 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SH3BP5O60239 455 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SIN3BO75182 1162 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SEMA4FO95754 770 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 IGLV3-27P01718 113 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PDGFRAP16234 1089 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF18P17022 549 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PMLP29590 882 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 HOXD12P35452 270 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PSMD8P48556 350 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SNX16P57768 344 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CENPCQ03188 943 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 RING1Q06587 406 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 GRIK2Q13002 908 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 KCNJ12Q14500 433 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 MAN2A1Q16706 1144 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PTPRNQ16849 979 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 POM121L1PQ3SYA9 428 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 VWA3BQ502W6 1294 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 FSCBQ5H9T9 825 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 LAYNQ6UX15 382 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 APCDD1Q8J025 514 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SCML4Q8N228 414 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 FIBINQ8TAL6 211 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CPXM1Q96SM3 734 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 VPS16Q9H269 839 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 NDST4Q9H3R1 872 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 GAREM1Q9H706 876 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CAPN10Q9HC96 672 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 CD248Q9HCU0 757 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 TAB2Q9NYJ8 693 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-209ENST00000480420 ERVW-1Q9UQF0 538 aa8.35□□□□□ -1.07
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