RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-208ENST00000436638 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 USP33Q8TEY7 942 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 TWNKQ96RR1 684 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 KRT82Q9NSB4 513 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 EHD2Q9NZN4 543 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 LUZP4Q9P127 313 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 YIPF1Q9Y548 306 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 NME7Q9Y5B8 376 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.46□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 VWA8A3KMH1 1905 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 LRRC53A6NM62 1247 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 F8VP50 259 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 M0QYV0 167 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CCL16O15467 120 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 LINC01565O15544 149 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 AP5Z1O43299 807 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 TIAF1O95411 115 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 SEC24AO95486 1093 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CSH1P0DML2 217 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CSH2P0DML3 217 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CYP11B1P15538 503 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CYP2F1P24903 491 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 HOXA9P31269 272 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CASP14P31944 242 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 PBX1P40424 430 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 RWDD2BP57060 319 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 MAP3K7CLP57077 242 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 BPIFB3P59826 476 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 DDR2Q16832 855 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CYP4A22Q5TCH4 519 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CCDC80Q76M96 950 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 VPS36Q86VN1 386 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF677Q86XU0 584 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 FUKQ8N0W3 1084 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 UBA3Q8TBC4 463 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 NOX5Q96PH1 765 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 GCNAQ96QF7 691 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 PKMYT1Q99640 499 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 APOL5Q9BWW9 433 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 DUSP16Q9BY84 665 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 MIS12Q9H081 205 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 COG5Q9UP83 839 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 FAM50BQ9Y247 325 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 ASB3Q9Y575 518 aa6.45□□□□□ -1.38
ECHDC1-208ENST00000436638 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms