RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ST8SIA6P61647 398 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2HP62256 183 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 RPS24P62847 133 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 FAM193AP78312 1265 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 PDCLQ13371 301 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 USP30Q70CQ3 517 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 FAM124AQ86V42 546 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 MYEOVQ96EZ4 313 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 MRGPRX3Q96LB0 322 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 STIM2Q9P246 746 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 BECN2A8MW95 431 aa21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SEMA4FO95754 770 aa21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 GLI1P08151 1106 aa21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 MATKP42679 507 aa21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 DCAF6Q58WW2 860 aa21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 GBP6Q6ZN66 633 aa21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 GLRX5Q86SX6 157 aa21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM32Q8TC27 787 aa21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SHC3Q92529 594 aa21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 CBFA2T3O75081 653 aa21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 BNC1Q01954 994 aa21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 FSCBQ5H9T9 825 aa21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 DBX2Q6ZNG2 339 aa21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 GAREM1Q9H706 876 aa21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 AKAP13Q12802 2813 aa21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 MOCS3O95396 460 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SLC9A1P19634 815 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 TACR2P21452 398 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 GRIA4P48058 902 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SLC12A1Q13621 1099 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 PITRM1Q5JRX3 1037 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 BIRC7Q96CA5 298 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 CAMK1GQ96NX5 476 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ACP6Q9NPH0 428 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 TM7SF3Q9NS93 570 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ERVW-1Q9UQF0 538 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ZZEF1O43149 2961 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 SIN3BO75182 1162 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 SLC2A3P11169 496 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CD27P26842 260 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 MTA1Q13330 715 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 TEAD4Q15561 434 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-BQ31612 363 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 RAP1GAP2Q684P5 730 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 GJB7Q6PEY0 223 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CHSY1Q86X52 802 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 LGI2Q8N0V4 545 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP52Q8N1V2 620 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 MLKLQ8NB16 471 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 SNX19Q92543 992 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 IL21RQ9HBE5 538 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 TM9SF3Q9HD45 589 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 KLK13Q9UKR3 277 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 F5H5T6 163 aa21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 HSF2BPO75031 334 aa21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 PON1P27169 355 aa21.69■■□□□ 1.06
LIMS1-208ENST00000428064 ECT2LQ008S8 904 aa21.69■■□□□ 1.06
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