RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 TSPAN3O60637 253 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 XBP1P17861 261 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 IGFBP2P18065 325 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 GRK5P34947 590 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 COPB1P53618 953 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TRPC3Q13507 836 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 SLC12A1Q13621 1099 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 WDR93Q6P2C0 686 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 CHSY1Q86X52 802 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 FSIP1Q8NA03 581 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 PIGSQ96S52 555 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 RAB21Q9UL25 225 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 FZD4Q9ULV1 537 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 LMTK3Q96Q04 1460 aa3.46□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D3EA0A087X179 549 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D3BA6NDS4 549 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 WIPF3A6NGB9 483 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TISP43B9A030 160 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D3LB9A6J9 549 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D3HP0C7X1 549 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 GALNSP34059 522 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 PTGER1P34995 402 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 PCP4P48539 62 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 JAK3P52333 1124 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 FOXL2P58012 376 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 RETSATQ6NUM9 610 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 ESX1Q8N693 406 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 DDB2Q92466 427 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 REEP2Q9BRK0 252 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 USP29Q9HBJ7 922 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 ASIC5Q9NY37 505 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 PNMA2Q9UL42 364 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 LINC01548A6NM66 108 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 H3BNC9 293 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 H7C1Q1 480 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 STX16O14662 325 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 PRKCGP05129 697 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 CYP3A7P24462 503 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 RCAN1P53805 252 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TAS2R50P59544 299 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 PDCLQ13371 301 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 DLGAP5Q15398 846 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF484Q5JVG2 852 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 ANO7Q6IWH7 933 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 PTF1AQ7RTS3 328 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 LAS2Q8IYD9 372 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 HTRA1Q92743 480 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 RITA1Q96K30 269 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 SLC12A4Q9UP95 1085 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa3.45□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 VWA3AA6NCI4 1184 aa3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 AGAP5A6NIR3 686 aa3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TTC34A8MYJ7 566 aa3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 GCATO75600 419 aa3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 MT-CO3P00414 261 aa3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TNNT1P13805 278 aa3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP5-9P26371 169 aa3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 TUBA4AP68366 448 aa3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 MPP1Q00013 466 aa3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 CNGA3Q16281 694 aa3.44□□□□□ -1.86
CCDC82-202ENST00000423339 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms