RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 ULK2Q8IYT8 1036 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 DTX3LQ8TDB6 740 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 PPP4R1Q8TF05 950 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 CEP41Q9BYV8 373 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 M0QYT0 321 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 KLHL2O95198 593 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 PROCP04070 461 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 CYP2C9P11712 490 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 SKIP12755 728 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 KCNA4P22459 653 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 KLC1Q07866 573 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 TUBB3Q13509 450 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 DPYSQ14117 519 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 GRTP1Q5TC63 336 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 OSTM1Q86WC4 334 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 TOP6BLQ8N6T0 577 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 KCTD13Q8WZ19 329 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 CPNE1Q99829 537 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 THTPAQ9BU02 230 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 LRCH1Q9Y2L9 728 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 DEUP1Q05D60 604 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 LDLRAD1Q5T700 205 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 NETO2Q8NC67 525 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 WNT8BQ93098 351 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 CERS2Q96G23 380 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC4Q9HBW1 653 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 RNF181Q9P0P0 153 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 COX16Q9P0S2 106 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD13-201ENST00000392539 PDHXO00330 501 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 NPR3P17342 541 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 TYK2P29597 1187 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 IRGCQ6NXR0 463 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 RFX8Q6ZV50 586 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 PID1Q7Z2X4 250 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 SLC10A4Q96EP9 437 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 MAML3Q96JK9 1138 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 SLC2A13Q96QE2 648 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 ADAM28Q9UKQ2 775 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa27.08■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 DCLK1O15075 740 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 PDHA1P08559 390 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 C10orf107Q8IVU9 208 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 DNAJC28Q9NX36 388 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 ERVK-10P10266 1014 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 MX2P20592 715 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 RABGAP1LQ5R372 815 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 FAM136AQ96C01 138 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 SOX13Q9UN79 622 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 RAD54BQ9Y620 910 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 MAP3K7O43318 606 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 PRKCGP05129 697 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 MLH1P40692 756 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 LILRA4P59901 499 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 NME3Q13232 169 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC40Q9H9A6 602 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 COPG2Q9UBF2 871 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 AIF1P55008 147 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 ACTR3P61158 418 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC153Q494R4 210 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 PANX3Q96QZ0 392 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 SLC9A7Q96T83 725 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 TINF2Q9BSI4 451 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 RNF39Q9H2S5 420 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM216Q9P0N5 145 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 SLC7A8Q9UHI5 535 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 CLDN5O00501 218 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 MYL4P12829 197 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 LBRQ14739 615 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 PPM1JQ5JR12 505 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 SYPL2Q5VXT5 272 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 ISL2Q96A47 359 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 SORT1Q99523 831 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 GPAMQ9HCL2 828 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 PIGVQ9NUD9 493 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD13-201ENST00000392539 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms