RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366960.7

RPS6KC1-202, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-202ENST00000366960 FAM50BQ9Y247 325 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 RGL2O15211 777 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 PSMB4P28070 264 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 RRM2P31350 389 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 MIEF2Q96C03 454 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TKTL2Q9H0I9 626 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 HES2Q9Y543 173 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 MEIS2O14770 477 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 LDLRP01130 860 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 RENBPP51606 427 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 DNERQ8NFT8 737 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 POLG2Q9UHN1 485 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNF862O60290 1169 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TBX4P57082 545 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ANKS6Q68DC2 871 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ALG3Q92685 438 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TGFB3P10600 412 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ALADP13716 330 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 FLT3P36888 993 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ALDH9A1P49189 494 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 WDR18Q9BV38 432 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 VTA1Q9NP79 307 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 KCND1Q9NSA2 647 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 COMMD8Q9NX08 183 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TNS2Q63HR2 1409 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 BTN3A1O00481 513 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 KRT36O76013 467 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 BDNFP23560 247 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 FMO1Q01740 532 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNF284Q2VY69 593 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SPATA20Q8TB22 786 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 VPS33AQ96AX1 596 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SAR1AQ9NR31 198 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 VPS45Q9NRW7 570 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 LIASO43766 372 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 HS6ST1O60243 411 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SEC22BO75396 215 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 UNC5CO95185 931 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 BCL10O95999 233 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 BST1Q10588 318 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 APBB2Q92870 758 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TADA1Q96BN2 335 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 PSMD10O75832 226 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 PAEPP09466 180 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TSPAN8P19075 237 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 MAPK1P28482 360 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 CAPZA2P47755 286 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 MED8Q96G25 268 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZFP42Q96MM3 310 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SH3GL1Q99961 368 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 FCGR1AP12314 374 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 FMO4P31512 558 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 NR2C2P49116 596 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ATG7O95352 703 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SLC9A5Q14940 896 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 ALFQ53S48 1182 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 SAMD3Q8N6K7 520 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 OPTNQ96CV9 577 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 TPD52L3Q96J77 140 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 BDH2Q9BUT1 245 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS6KC1-202ENST00000366960 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms