RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 C21orf58P58505 322 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ADAM17P78536 824 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA8FQ08AF8 430 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 LAPTM5Q13571 262 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SYCP1Q15431 976 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 HYAL4Q2M3T9 481 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CBWD5Q5RIA9 395 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KDELC1Q6UW63 502 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 OLFM4Q6UX06 510 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DBX2Q6ZNG2 339 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf186Q6ZWK4 172 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CPNE8Q86YQ8 564 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FAM114A1Q8IWE2 563 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CNNM3Q8NE01 707 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MGARPQ8TDB4 240 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 OTULINQ96BN8 352 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CYFIP2Q96F07 1278 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MIPEPQ99797 713 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DBNDD2Q9BQY9 259 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MAGEB5Q9BZ81 275 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SIL1Q9H173 461 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KCNH6Q9H252 994 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SEMA3GQ9NS98 782 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MID2Q9UJV3 735 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KMT2EQ8IZD2 1858 aa2.65□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 H0YC42 278 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 AP3D1O14617 1153 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SLC27A2O14975 620 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PALMO75781 387 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GAP43P17677 238 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CDKN1AP38936 164 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PRKCZQ05513 592 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CHAF1BQ13112 559 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CAMK1Q14012 370 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 HSP90B2PQ58FF3 399 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA46Q5T0L3 261 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MROH9Q5TGP6 573 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 LIPMQ5VYY2 423 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ISM2Q6H9L7 571 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 THAP5Q7Z6K1 395 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GPR149Q86SP6 731 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 PLXDC1Q8IUK5 500 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM57Q8N5G2 664 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DNERQ8NFT8 737 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 XAGE3Q8WTP9 111 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TAF4BQ92750 862 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TRIB1Q96RU8 372 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ABHD1Q96SE0 405 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 AP5S1Q9NUS5 200 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 USP40Q9NVE5 1235 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 HYPKQ9NX55 129 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SH3BP4Q9P0V3 963 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 OSGIN1Q9UJX0 560 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MYO6Q9UM54 1294 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA0232Q92628 1395 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 IGSF1Q8N6C5 1336 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 OVOS2Q6IE36 1432 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 LEFTY1O75610 366 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TSPAN9O75954 239 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 LRG1P02750 347 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC159P0C7I6 412 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 KLRK1P26718 216 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GP5P40197 560 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 VPS41P49754 854 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 SOX8P57073 446 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MAMLD1Q13495 774 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GRM4Q14833 912 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF484Q5JVG2 852 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DCAF12L1Q5VU92 463 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 FYB2Q5VWT5 728 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 GPR139Q6DWJ6 353 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 CDPF1Q6NVV7 123 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 MSANTD2Q6P1R3 559 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ARMC9Q7Z3E5 817 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 OCC1Q8TAD7 63 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 ETNPPLQ8TBG4 499 aa2.64□□□□□ -1.99
CCSAP-202ENST00000366686 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms