RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 DCLK1O15075 740 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 AP5Z1O43299 807 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 PRKCHP24723 683 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 SDC4P31431 198 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 ZBED6P86452 979 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 MBLAC2Q68D91 279 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJC24Q6P3W2 148 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 WDR59Q6PJI9 974 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF683Q8IZ20 524 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 AHI1Q8N157 1196 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 HMGB4Q8WW32 186 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 GAB3Q8WWW8 586 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 SLC6A17Q9H1V8 727 aa27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 RPP40O75818 363 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 ENDOD1O94919 500 aa27.87■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 F9P00740 461 aa27.87■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 GABRG2P18507 467 aa27.87■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CASP14P31944 242 aa27.87■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 ENPP2Q13822 863 aa27.87■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 PTPRNQ16849 979 aa27.87■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 OR52K2Q8NGK3 314 aa27.87■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 MCEEQ96PE7 176 aa27.87■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 SIGLEC16A6NMB1 481 aa27.86■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 H0Y626 953 aa27.86■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CNR2P34972 360 aa27.86■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 PTPN9P43378 593 aa27.86■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 OGDHQ02218 1023 aa27.86■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 DCLK2Q8N568 766 aa27.86■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 UCMAQ8WVF2 138 aa27.86■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 GPR179Q6PRD1 2367 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CNTN5O94779 1100 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 HLA-EP13747 358 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 GPD1P21695 349 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 HDAC4P56524 1084 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 RABGAP1LQ5R372 815 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 SDE2Q6IQ49 451 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CEP68Q76N32 757 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 APCDD1Q8J025 514 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 FRMD1Q8N878 549 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF366Q8N895 744 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 RLN3Q8WXF3 142 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 MAGEB5Q9BZ81 275 aa27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1B0GVM2 712 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 TCAF2A6NFQ2 919 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CCP110O43303 1012 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CBFA2T2O43439 604 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 ALDH1A2O94788 518 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 TPM3P06753 285 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFV2P19404 249 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CSKP41240 450 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 C5orf22Q49AR2 442 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 ALFQ53S48 1182 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 PITRM1Q5JRX3 1037 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 KBTBD6Q86V97 674 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 FAM172AQ8WUF8 416 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CD93Q9NPY3 652 aa27.84■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 TIMM44O43615 452 aa27.83■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 FTLP02792 175 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 BCKDHBP21953 392 aa27.83■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 MAMLD1Q13495 774 aa27.83■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa27.83■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 VSTM4Q8IW00 320 aa27.83■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC185Q8N715 623 aa27.83■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 IQCDQ96DY2 449 aa27.83■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa27.83■■■□□ 2.05
TPGS1-201ENST00000359315 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 DLDP09622 509 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 MTA1Q13330 715 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 STRADAQ7RTN6 431 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 PGBD3Q8N328 593 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 TTC17Q96AE7 1141 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 MYO19Q96H55 970 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 VCPIP1Q96JH7 1222 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 MRGPRX3Q96LB0 322 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM7Q9C029 511 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 RBSNQ9H1K0 784 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM245Q9H330 911 aa27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms