RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356435.9

PTPRD-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-202ENST00000356435 TSPAN3O60637 253 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 CCNDBP1O95273 360 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 HLA-DQA2P01906 255 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 SLC2A4P14672 509 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 GRK2P25098 689 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 SERPINB5P36952 375 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 ITGA1P56199 1179 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 STX4Q12846 297 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 TMEM26Q6ZUK4 368 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 GPC2Q8N158 579 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 OR52L1Q8NGH7 329 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 ZFP28Q8NHY6 868 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 TMC2Q8TDI7 906 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 ATP8B4Q8TF62 1192 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 TMEM176AQ96HP8 235 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 CLCC1Q96S66 551 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 CCDC28BQ9BUN5 200 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 ACOT9Q9Y305 439 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 RGS5O15539 181 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 RPL9P32969 192 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 KLHL35Q6PF15 583 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 GPR141Q7Z602 305 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 GLMNQ92990 594 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 C10orf88Q9H8K7 445 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 LRRC4BQ9NT99 713 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 KLRC1P26715 233 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 FAIM2Q9BWQ8 316 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRD-202ENST00000356435 ISCUQ9H1K1 167 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 ZNF711Q9Y462 761 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRD-202ENST00000356435 B2RBV5 119 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 SLC39A12Q504Y0 691 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 TMEM86AQ8N2M4 240 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 DPY30Q9C005 99 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 GPRC5DQ9NZD1 345 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 CYP2F1P24903 491 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 PDX1P52945 283 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 MCL1Q07820 350 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 RCN1Q15293 331 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 NDUFV1P49821 464 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 RGS1Q08116 209 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 NAB1Q13506 487 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRD-202ENST00000356435 ARMC4Q5T2S8 1044 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 SLC30A9Q6PML9 568 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 IKBIPQ70UQ0 350 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRD-202ENST00000356435 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa5.65□□□□□ -1.51
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