RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TFRCP02786 760 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 POLD2P49005 469 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 NLGN1Q8N2Q7 840 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 GANCQ8TET4 914 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM172AQ8WUF8 416 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF302Q9NR11 478 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF221Q9UK13 617 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 THAP2Q9H0W7 228 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PTGS2P35354 604 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PTF1AQ7RTS3 328 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 OTOAQ7RTW8 1153 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CLCA2Q9UQC9 943 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFAF1Q9Y375 327 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC88CQ9P219 2028 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SDC2P34741 201 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC1A6P48664 564 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 STRIP1Q5VSL9 837 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 WRNIP1Q96S55 665 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 IGSF1Q8N6C5 1336 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CPA3P15088 417 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEA8P43361 318 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKS6Q68DC2 871 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 USP49Q70CQ1 688 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CHMP1BQ7LBR1 199 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ADI1Q9BV57 179 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ADGRE3Q9BY15 652 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 H0YJX3 145 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP10.84□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 31.8
SH3BP2-201ENST00000356331 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 USP4Q13107 963 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PTPAQ15257 358 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC25A24Q6NUK1 477 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SMIM5Q71RC9 77 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF438Q7Z4V0 828 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 QRFPRQ96P65 431 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR41Q9HAD4 459 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D13Q9NVG8 400 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 GIN1Q9NXP7 522 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DUSP12Q9UNI6 340 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PPLO60437 1756 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 GRK4P32298 578 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAM17P78536 824 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 SV2CQ496J9 727 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 GALNTL6Q49A17 601 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 PHC3Q8NDX5 983 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 TCP10LQ8TDR4 215 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 CITED4Q96RK1 184 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 VAT1Q99536 393 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 APOL2Q9BQE5 337 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-201ENST00000356331 USP17L5A8MUK1 530 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 M0QX08 132 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PROCP04070 461 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 RENBPP51606 427 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXO36Q8NEA4 188 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 NEDD1Q8NHV4 660 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 NMRAL1Q9HBL8 299 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 EHD3Q9NZN3 535 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 NUDT5Q9UKK9 219 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CLRN2A0PK11 232 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 IFNA7P01567 189 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 PROSER1Q86XN7 944 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 NT5C1AQ9BXI3 368 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 WWOXQ9NZC7 414 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 CROTQ9UKG9 612 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SMIM22K7EJ46 135 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ADORA2BP29275 332 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 SQLEQ14534 574 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 EPHX4Q8IUS5 362 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ZFAND2BQ8WV99 257 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 REEP1Q9H902 201 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-201ENST00000356331 GPD1P21695 349 aa10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms