RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 PLIN5Q00G26 463 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 RHBDF1Q96CC6 855 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 TELO2Q9Y4R8 837 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 ZNF671Q8TAW3 534 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 VPS51Q9UID3 782 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 NCANO14594 1321 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 GLP2RO95838 553 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 GSTT2BP0CG30 244 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 ACTR3P61158 418 aa5.62□□□□□ -1.51
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