RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 GAB3Q8WWW8 586 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RAPGEF5Q92565 580 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CPB2Q96IY4 423 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC114Q96M63 670 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 KIFC3Q9BVG8 833 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DCLK3Q9C098 648 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MIS12Q9H081 205 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFP14Q9HCL3 533 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 GDE1Q9NZC3 331 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 KLK14Q9P0G3 267 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0B4J269 797 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 LNP1A1A4G5 178 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM66O15016 1216 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 OGTO15294 1046 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TOM1L1O75674 476 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 IL18RAPO95256 599 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 P4HA1P13674 534 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DESP17661 470 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 GLRA2P23416 452 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 AKAP5P24588 427 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1D2P34982 312 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPN7P35236 360 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MARCKSL1P49006 195 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 LIG3P49916 1009 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 NOMO3P69849 1222 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 IFT88Q13099 833 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 NCOA4Q13772 614 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC32Q14392 662 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ITIH4Q14624 930 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJC24Q6P3W2 148 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DCUN1D2Q6PH85 259 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM270Q6UE05 265 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MON1BQ7L1V2 547 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PCGF5Q86SE9 256 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB124Q8NES8 71 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXJ1Q92949 421 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM143Q96AN5 459 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ITPKCQ96DU7 683 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 LOXL4Q96JB6 756 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CORO1BQ9BR76 489 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TCHPQ9BT92 498 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TTPALQ9BTX7 342 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC134Q9H6E4 229 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS45Q9NRW7 570 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PI4KAP42356 2102 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP99D6REC4 459 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN1O60635 241 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH16O75309 829 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC4O95801 387 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKCBP05771 671 aa7.3□□□□□ -1.24
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