RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259008.6

BRIP1-201, Transcript of BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRIP1, Length 6,048 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1-201ENST00000259008 DLG5Q8TDM6 1919 aa6.51□□□□□ -1.37
BRIP1-201ENST00000259008 ASTN1O14525 1302 aa6.51□□□□□ -1.37
BRIP1-201ENST00000259008 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.51□□□□□ -1.37
BRIP1-201ENST00000259008 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
BRIP1-201ENST00000259008 CYP2A7P20853 494 aa6.51□□□□□ -1.37
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BRIP1-201ENST00000259008 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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BRIP1-201ENST00000259008 CD84Q9UIB8 345 aa6.5□□□□□ -1.37
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BRIP1-201ENST00000259008 PAX3P23760 479 aa6.5□□□□□ -1.37
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BRIP1-201ENST00000259008 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.5□□□□□ -1.37
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BRIP1-201ENST00000259008 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.5□□□□□ -1.37
BRIP1-201ENST00000259008 NPNTQ6UXI9 565 aa6.5□□□□□ -1.37
BRIP1-201ENST00000259008 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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BRIP1-201ENST00000259008 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
BRIP1-201ENST00000259008 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BRIP1-201ENST00000259008 PCED1BQ96HM7 432 aa6.5□□□□□ -1.37
BRIP1-201ENST00000259008 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
BRIP1-201ENST00000259008 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.5□□□□□ -1.37
BRIP1-201ENST00000259008 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.5□□□□□ -1.37
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