RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 FGD2Q7Z6J4 655 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 MYO1HQ8N1T3 1032 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 PCMTD2Q9NV79 361 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ATAD3AQ9NVI7 634 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 STK39Q9UEW8 545 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 AP4S1Q9Y587 144 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ASGR1P07306 291 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 EPB42P16452 691 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 MSH3P20585 1137 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 POU4F1Q01851 419 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 LBX2Q6XYB7 198 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 TPGS1Q6ZTW0 290 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 LRRC8DQ7L1W4 858 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 C16orf59Q7L2K0 433 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 IFNL1Q8IU54 200 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 EMC1Q8N766 993 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 PACSIN1Q9BY11 444 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ADNPQ9H2P0 1102 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 MAN1C1Q9NR34 630 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ARIH2O95376 493 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 USP17L7P0C7H9 530 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ACOX1Q15067 660 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ARHGAP17Q68EM7 881 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 MARCH2Q9P0N8 246 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ADGRA2Q96PE1 1338 aa11.13□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ANGPT2O15123 496 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 TRIM24O15164 1050 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 JCHAINP01591 159 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ITGAXP20702 1163 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 CYP2F1P24903 491 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 HPCAP84074 193 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 GCNT1Q02742 428 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 PRKCZQ05513 592 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 CCNJLQ8IV13 435 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 LZTR1Q8N653 840 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 OMDQ99983 421 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 POPDC2Q9HBU9 364 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ATRNO75882 1429 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SERPINF2P08697 491 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 MAPK9P45984 424 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 FAM83EQ2M2I3 478 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 MTMR9Q96QG7 549 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 RRM1P23921 792 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 KCNMA1Q12791 1236 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 TUBA3EQ6PEY2 450 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 KLHL24Q6TFL4 600 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 IL31RAQ8NI17 732 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ABHD8Q96I13 439 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 FAM25AB3EWG3 89 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 FAM25CB3EWG5 89 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 FAM25GB3EWG6 89 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 O00370 1275 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 PROSCO94903 275 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 PRLP01236 227 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 LTFP02788 710 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 FAM153BP0C7A2 387 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 HDCP19113 662 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 PSEN1P49768 467 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 APLP1P51693 650 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 CDH8P55286 799 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 FAM153CQ494X1 144 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SGO1Q5FBB7 561 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ZNF606Q8WXB4 792 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 FAM105AQ9NUU6 356 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 FAM153AQ9UHL3 310 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SEMA3DO95025 777 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 SLURP2P0DP57 97 aa11.12□□□□□ -0.63
URB2-201ENST00000258243 ARPC4P59998 168 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms