RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 MLNP12872 115 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 PTPN3P26045 913 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 YWHAQP27348 245 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 SMARCB1Q12824 385 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR17Q13304 367 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 MPP2Q14168 576 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR152Q8TDT2 470 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 DCAKDQ8WVC6 231 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXO32Q969P5 355 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 SGSM3Q96HU1 749 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 SIGLEC10Q96LC7 697 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 TTPALQ9BTX7 342 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 OSER1Q9NX31 292 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 GMIPQ9P107 970 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 PRDM4Q9UKN5 801 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 SHROOM3Q8TF72 1996 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 SPAG7O75391 227 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 UPP2O95045 317 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 VIMP08670 466 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 GRIA1P42261 906 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 USP46P62068 366 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 COG7P83436 770 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 TLE2Q04725 743 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 RTP2Q5QGT7 225 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 MICALCLQ6ZW33 695 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 C4orf33Q8N1A6 199 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 GDAP1Q8TB36 358 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 KIF9Q9HAQ2 790 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa24.6■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 NUP205Q92621 2012 aa24.59■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa24.59■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 MTMR11A4FU01 709 aa24.59■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC2A3P11169 496 aa24.59■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM60Q495X7 471 aa24.59■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 CTAGE3PQ8IX95 158 aa24.59■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 TLR6Q9Y2C9 796 aa24.59■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.531e-6■■■■□ 22.4
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RPUSD1-201ENST00000007264 MSANTD2Q6P1R3 559 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 CASC4Q6P4E1 433 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC8BQ6P9F7 803 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC44A1Q8WWI5 657 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 TRHDEQ9UKU6 1024 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 TTLL3Q9Y4R7 772 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1W2PPM1 405 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 SOAT2O75908 522 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 APOEP02649 317 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 QPCTQ16769 361 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa24.58■■□□□ 1.53
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RPUSD1-201ENST00000007264 UNC5AQ6ZN44 842 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 MPP5Q8N3R9 675 aa24.58■■□□□ 1.53
RPUSD1-201ENST00000007264 GSDMBQ8TAX9 411 aa24.58■■□□□ 1.53
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RPUSD1-201ENST00000007264 VAT1Q99536 393 aa24.58■■□□□ 1.53
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RPUSD1-201ENST00000007264 IKBKEQ14164 716 aa24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC6Q86X45 466 aa24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 PPM1NQ8N819 430 aa24.57■■□□□ 1.52
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RPUSD1-201ENST00000007264 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
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RPUSD1-201ENST00000007264 SDR42E2A6NKP2 422 aa24.57■■□□□ 1.52
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RPUSD1-201ENST00000007264 PSEN1P49768 467 aa24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC18A1P54219 525 aa24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 TBX4P57082 545 aa24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 IL9RQ01113 521 aa24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC26A11Q86WA9 606 aa24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC34Q8IZ02 419 aa24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 LZTR1Q8N653 840 aa24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 CKAP2Q8WWK9 683 aa24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 AGAP3Q96P47 875 aa24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.57■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.56■■□□□ 1.52
RPUSD1-201ENST00000007264 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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