RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NfkbizQ9EST8 728 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ap4b1Q9WV76 738 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc4a9E9PUP3 929 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cd86P42082 309 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Scarf2P59222 833 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pyroxd1Q3TMV7 498 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Olfm4Q3UZZ4 505 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Etaa1Q5SVT3 877 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ProcrQ64695 242 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ChfrQ810L3 664 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 TbcdQ8BYA0 1196 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cnot6Q8K3P5 557 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam162aQ9D6U8 155 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Poc5Q9DBS8 558 aa9.61□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Wdr49A0A0N4SUK7 710 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mageb4A2A9R3 556 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc16a6B1AT66 607 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CrymO54983 313 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm1604bQ3TRG0 118 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lsg1Q3UM18 644 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ADGRF3Q58Y75 991 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Proser1Q5PRE5 913 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sarm1Q6PDS3 724 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ErfeQ6PGN1 340 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ItchQ8C863 864 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mark4Q8CIP4 752 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Olfr809Q8VEX8 328 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Vangl2Q91ZD4 521 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CabyrQ9D424 453 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rnf14Q9JI90 485 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trpm5Q9JJH7 1158 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PigqQ9QYT7 581 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc62E9PVD1 701 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zfp105G3X9I0 524 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ebf3O08791 596 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CfhP06909 1234 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc11a2P49282 568 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pms2P54279 859 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ZbbxQ0P5X5 716 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mapk15Q80Y86 549 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Chst12Q99LL3 419 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kif19Q99PT9 997 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CacybpQ9CXW3 229 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Clca1Q9D7Z6 913 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm6205E9PZS2 359 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trdmt1O55055 415 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Stam2O88811 523 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Abce1P61222 599 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ThraP63058 492 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lrrn4clQ3TYX2 239 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Traf3Q60803 567 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ecm1Q61508 559 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zfp759Q7M6X3 721 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Elmo2Q8BHL5 732 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cops7bQ8BV13 264 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kcnv1Q8BZN2 503 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm6367Q8C6L9 287 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Castor2Q8CAB8 329 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trim32Q8CH72 655 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Olfr30Q8VGD8 315 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Creld1Q91XD7 420 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cog2Q921L5 731 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gstt4Q9D4P7 240 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PolhQ9JJN0 694 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Bace2Q9JL18 514 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Akr1c12Q9JLI0 323 aa9.6□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Osbpl8B9EJ86 889 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SprtnG3X912 497 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 OmdO35103 423 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ShdO88834 343 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mxd1P50538 227 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 St3gal1P54751 337 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 HmgcrQ01237 887 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nr2c1Q505F1 590 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 N4bp1Q6A037 893 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sel1l3Q80TS8 1137 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Alkbh8Q80Y20 664 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SybuQ8BHS8 665 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ticam2Q8BJQ4 232 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pacs1Q8K212 961 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam151aQ8QZW3 608 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Snx15Q91WE1 337 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam192aQ91WE2 254 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 TfQ921I1 697 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trmt11Q9CWH5 460 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam212aQ9CX62 282 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Borcs5Q9D920 195 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Piwil1Q9JMB7 862 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PignQ9R1S3 931 aa9.59□□□□□ -0.87
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CdylQ9WTK2 593 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.9 ms