RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.01□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SDCBP2Q9H190 292 aa9.01□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.01□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 A0A1W2PP55 124 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 A0A1W2PR77 199 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SLC12A8A0AV02 714 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 TLR4O00206 839 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 CLIC2O15247 247 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 KIF20AO95235 890 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ADH1BP00325 375 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ASLP04424 464 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 WNT1P04628 370 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 MPOP05164 745 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SLFN14P0C7P3 912 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ASPAP45381 313 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 GALCP54803 685 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 AMPD3Q01432 767 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 CST6Q15828 149 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 PROX2Q3B8N5 592 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.978e-9■■■■□ 24.8
HLA-B-257ENST00000640094 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SCD5Q86SK9 330 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ADIPOR2Q86V24 386 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 IQCHQ86VS3 1027 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 LURAP1LQ8IV03 231 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 MFSD2AQ8NA29 543 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF507Q8TCN5 953 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF516Q92618 1163 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 HPS3Q969F9 1004 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 CUEDC2Q9H467 287 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 USP3Q9Y6I4 520 aa9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 MID1O15344 667 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 TGFB1I1O43294 461 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 LATO43561 262 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ALPPL2P10696 532 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 HOXD13P35453 343 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 LSSP48449 732 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ADPRHP54922 357 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 CLDN10P78369 228 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 ARID5BQ14865 1188 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 RABEP1Q15276 862 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SGO2Q562F6 1265 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 MPP7Q5T2T1 576 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 MFN1Q8IWA4 741 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 KDM1BQ8NB78 822 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 DUSP16Q9BY84 665 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 USP29Q9HBJ7 922 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 DMTF1Q9Y222 760 aa8.99□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 K7ENP7 123 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 IRAK2O43187 625 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SIGLEC6O43699 453 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SDC3O75056 442 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 SIN3BO75182 1162 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 USP12O75317 370 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 CSO75390 466 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 VNN1O95497 513 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 GP1BAP07359 652 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 GOT1P17174 413 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 C5AR1P21730 350 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 PSMD8P48556 350 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 CASP4P49662 377 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 BNIP3Q12983 259 aa8.98□□□□□ -0.97
HLA-B-257ENST00000640094 CDH18Q13634 790 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms