RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 MPOP05164 745 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 TPH1P17752 444 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 PPP2R1BP30154 601 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 LSP1P33241 339 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 RAB14P61106 215 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 TRIP10Q15642 601 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 SLC45A4Q5BKX6 768 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 SLC26A11Q86WA9 606 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 PNMA5Q96PV4 448 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 APBA2Q99767 749 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 SH3GL1Q99961 368 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 TMEM51Q9NW97 253 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 TBC1D3BA6NDS4 549 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.623e-7■■■■□ 26.7
TNS1-221ENST00000615025 AMPD1P23109 780 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 NR2C2P49116 596 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 SLC12A3P55017 1021 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 CCL23P55773 120 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 GCNT1Q02742 428 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 MGAT5Q09328 741 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 MAP4K3Q8IVH8 894 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 PPP1R16AQ96I34 528 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 CCT7Q99832 543 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11.2□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 EML1O00423 815 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 ALDH9A1P49189 494 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 NFYCQ13952 458 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 MDM1Q8TC05 714 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 CNBD2Q96M20 576 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 SOX13Q9UN79 622 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 ATP6V1C1P21283 382 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 HTR3CQ8WXA8 447 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 SEPT3Q9UH03 358 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 NDOR1Q9UHB4 597 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 NDUFS2O75306 463 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 NFICP08651 508 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 THRAP10827 490 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 KCNA3P22001 575 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 CD151P48509 253 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 NOGQ13253 232 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 FBXL19Q6PCT2 694 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 LRRC8DQ7L1W4 858 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 FIBCD1Q8N539 461 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 RAD51BO15315 384 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 LTFP02788 710 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 SERPINB1P30740 379 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 LLGL2Q6P1M3 1020 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 MCOLN3Q8TDD5 553 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 ASZ1Q8WWH4 475 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 REPS1Q96D71 796 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 OMDQ99983 421 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 RGS18Q9NS28 235 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 RAB23Q9ULC3 237 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 SNX8Q9Y5X2 465 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 103.4
TNS1-221ENST00000615025 KANSL1LA0AUZ9 987 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 PRKD2Q9BZL6 878 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa11.19□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 NR5A2O00482 541 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 MICU2Q8IYU8 434 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 DPP10Q8N608 796 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 ACTL9Q8TC94 416 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 MRIQ9BWK5 157 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 MARCH2Q9P0N8 246 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 KLHL20Q9Y2M5 609 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 E9PBE3 544 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 CNPP09543 421 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 CPA3P15088 417 aa11.18□□□□□ -0.62
TNS1-221ENST00000615025 NPY2RP49146 381 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms