RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM62Q9BVG3 475 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 APOL6Q9BWW8 343 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 AP5M1Q9H0R1 490 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF408Q9H9D4 720 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFP69BQ9UJL9 534 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MGAMO43451 1857 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 EVPLQ92817 2033 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PPEF2O14830 753 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 KPNA6O60684 536 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC130P13994 396 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NPR3P17342 541 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CCND1P24385 295 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 IL4RP24394 825 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 L1CAMP32004 1257 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGEA3P43357 314 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GAD2Q05329 585 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CDK18Q07002 472 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SNX17Q15036 470 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CYS1Q717R9 158 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP57Q86XR8 500 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PPM1NQ8N819 430 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf69Q8N8R5 385 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC2A14Q8TDB8 520 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 KCTD13Q8WZ19 329 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP2A3Q93084 1043 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RRAGCQ9HB90 399 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC4Q9HBW1 653 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NPHS2Q9NP85 383 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RRN3Q9NYV6 651 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 Q9Y3F1 56 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM159BA6NKW6 160 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 BIRC5O15392 142 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MTSS1O43312 755 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 HAUS5O94927 633 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 THBS1P07996 1170 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 MYL3P08590 195 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM200BP0CF97 657 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PGAM1P18669 254 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 PAX3P23760 479 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 LRPAP1P30533 357 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NOS2P35228 1153 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GARSP41250 739 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 SERPINB4P48594 390 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ARFIP2P53365 341 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB16Q05516 673 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 FAAP100Q0VG06 881 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CA9Q16790 459 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 WLSQ5T9L3 541 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 STEAP4Q687X5 459 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 RSPH3Q86UC2 560 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 ACMSDQ8TDX5 336 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC17Q96AE7 1141 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms