RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587928.5

ILF3-208, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 4,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-208	ENST00000587928	CCT8	P50990	548 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	RAB41	Q5JT25	222 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	ACTL9	Q8TC94	416 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928		E5RJQ4	531 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	ACSL3	O95573	720 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	MORN1	Q5T089	497 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	FYB2	Q5VWT5	728 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	CCDC138	Q96M89	665 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	PGK2	P07205	417 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	STAG3L1	P0CL83	205 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	KCNE1	P15382	129 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	CDH8	P55286	799 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	CA9	Q16790	459 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	C2CD2L	O14523	706 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	SPTLC1	O15269	473 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	IGLV3-25	P01717	112 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	MAP3K7CL	P57077	242 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	MED21	Q13503	144 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	SUN5	Q8TC36	379 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	RNF157	Q96PX1	679 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	VPS41	P49754	854 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	KYAT1	Q16773	422 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	RNF169	Q8NCN4	708 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	NAT14	Q8WUY8	206 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	SENP1	Q9P0U3	644 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-208	ENST00000587928	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TXNDC9	O14530	226 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	INPPL1	O15357	1258 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	KRT1	P04264	644 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	DPYS	Q14117	519 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	IFT43	Q96FT9	208 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF670	Q9BS34	389 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	VTA1	Q9NP79	307 aa		11.21	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	F2	P00734	622 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TPSB2	P20231	275 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	STX2	P32856	288 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	HAL	P42357	657 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	OCRL	Q01968	901 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SEMA5A	Q13591	1074 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TPSAB1	Q15661	275 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	C9orf72	Q96LT7	481 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-208	ENST00000587928	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62

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