RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 PRKAA2P54646 552 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SLC12A3P55017 1021 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 HUNKP57058 714 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM169Q96HH4 297 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 OSMRQ99650 979 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 MID1IP1Q9NPA3 183 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 FCGRTP55899 365 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF614Q8N883 585 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ITGB6P18564 788 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CCR1P32246 355 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TTMPQ5BVD1 217 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 PGM2Q96G03 612 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 NSMCE2Q96MF7 247 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TBL1YQ9BQ87 522 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC154A6NI56 674 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CHST7Q9NS84 486 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SNPHO15079 494 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 INPP4BO15327 924 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 AHCYL1O43865 530 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 GJB6O95452 261 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SHMT1P34896 483 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ERO1BQ86YB8 467 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CROCCP3Q8IVE0 287 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO39Q8N4B4 442 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SYT15Q9BQS2 421 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 RGS18Q9NS28 235 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 IPPQ9Y573 584 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 FAM228AQ86W67 206 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 FNDC5Q8NAU1 212 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 BDH2Q9BUT1 245 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 MFSD4BQ5TF39 518 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC80Q76M96 950 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 STK32AQ8WU08 396 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SPON1Q9HCB6 807 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 AAASQ9NRG9 546 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 STK39Q9UEW8 545 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFA5Q16718 116 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CBWD6Q4V339 395 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ALFQ53S48 1182 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 DNERQ8NFT8 737 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 POMKQ9H5K3 350 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 MRASO14807 208 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CKMP06732 381 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SLC20A2Q08357 652 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 DDR2Q16832 855 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 FAM45BPQ6NSW5 357 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 RNF148Q8N7C7 305 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 NMRAL1Q9HBL8 299 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 EID3Q8N140 333 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 APBA2Q99767 749 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM150BA6NC51 233 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM114B3SHH9 223 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SNX32Q86XE0 403 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 SNX8Q9Y5X2 465 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 AADACL2Q6P093 401 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 FUKQ8N0W3 1084 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D12O60347 775 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ADRA1DP25100 572 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 DPYSL3Q14195 570 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms