RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 ACSL4O60488 711 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 SMC2O95347 1197 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 PAEPP09466 180 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 C7P10643 843 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 CD27P26842 260 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 GRIA4P48058 902 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 RGS7P49802 495 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 TBX4P57082 545 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 MFN1Q8IWA4 741 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 AZIN2Q96A70 460 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 STIM2Q9P246 746 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 SCML1Q9UN30 329 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC12A4-208ENST00000572010 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 PIK3R2O00459 728 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 CD70P32970 193 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 SGSHP51688 502 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 LRRC63Q05C16 580 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 CETN1Q12798 172 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 STILQ15468 1287 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 CNGA2Q16280 664 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 PKDCCQ504Y2 493 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 PMF1Q6P1K2 205 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 C19orf48Q6RUI8 117 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 IGSF8Q969P0 613 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC35C1Q96A29 364 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 NT5C1BQ96P26 610 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 KCNK3O14649 394 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 TNFSF14O43557 240 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 LTFP02788 710 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 GRK6P43250 576 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 CCT8P50990 548 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 UBR7Q8N806 425 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 FIBINQ8TAL6 211 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 MDM1Q8TC05 714 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 TFAP2BQ92481 460 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 SKA1Q96BD8 255 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 HSFY1Q96LI6 401 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 GPSM3Q9Y4H4 160 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 CKAP5Q14008 2032 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 M0QYV0 167 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 DFNA5O60443 496 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 FBXO21O94952 628 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 IGLV3-27P01718 113 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 ASLP04424 464 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC6A4P31645 630 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 FMO5P49326 533 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 C21orf59P57076 290 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 STIM1Q13586 685 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 INAVAQ3KP66 663 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 USP30Q70CQ3 517 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 CARNMT1Q8N4J0 409 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 WFDC5Q8TCV5 224 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 SMARCE1Q969G3 411 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 TTC17Q96AE7 1141 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 TOR4AQ9NXH8 423 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 PCDHGA12O60330 932 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 MIS12Q9H081 205 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 MTG2Q9H4K7 406 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 H0Y8X5 98 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 GABBR2O75899 941 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 MOCS3O95396 460 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 CSKP41240 450 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 RACK1P63244 317 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 CDH18Q13634 790 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 ACAP1Q15027 740 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC157Q569K6 752 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms