RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 LAYNQ6UX15 382 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 UNC93AQ86WB7 457 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF606Q8WXB4 792 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ING5Q8WYH8 240 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MAML3Q96JK9 1138 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PANX3Q96QZ0 392 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ECSITQ9BQ95 431 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF112Q9UJU3 913 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 KATNA1O75449 491 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 IFNA16P05015 189 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CAPSQ13938 189 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ACTR8Q9H981 624 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GULP1Q9UBP9 304 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 KLF15Q9UIH9 416 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 AIM2O14862 343 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 FMO4P31512 558 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PSMD8P48556 350 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TEAD4Q15561 434 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CYP2A13Q16696 494 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GSTA3Q16772 222 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CYP4Z1Q86W10 505 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM4Q9C037 500 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 FAM153AQ9UHL3 310 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GSAPA4D1B5 854 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GLRA3O75311 464 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PSMA3P25788 255 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 BRCC3P46736 316 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 NME5P56597 212 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RTP1P59025 263 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MCOLN2Q8IZK6 566 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ELMO1Q92556 727 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PIK3CDO00329 1044 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PRMT3O60678 531 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CDH16O75309 829 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TNFSF9P41273 254 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CDH17Q12864 832 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CRY2Q49AN0 593 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 E2F7Q96AV8 911 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MAGEB16A2A368 324 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 NFATC1O95644 943 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ANXA5P08758 320 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CHN1P15882 459 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 FNTAP49354 379 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PWP1Q13610 501 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 KYNUQ16719 465 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 DSELQ8IZU8 1212 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA20Q8TB22 786 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF536O15090 1300 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TREHO43280 583 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZBTB14O43829 449 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PSMD10O75832 226 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SLURP2P0DP57 97 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GPM6BQ13491 265 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 NLRP14Q86W24 1093 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 OR10G6Q8NH81 332 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 BBS4Q96RK4 519 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GPR20Q99678 358 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CDT1Q9H211 546 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CLDND1Q9NY35 253 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CNTNAP1P78357 1384 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GRM6O15303 877 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GSNP06396 782 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms