RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 FSCN3Q9NQT6 498 aa25.88■■□□□ 1.73
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PTPRJ-206ENST00000534219 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-206ENST00000534219 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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PTPRJ-206ENST00000534219 OXTRP30559 389 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-206ENST00000534219 RPS24P62847 133 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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PTPRJ-206ENST00000534219 GPR174Q9BXC1 333 aa25.87■■□□□ 1.73
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PTPRJ-206ENST00000534219 WDR45BQ5MNZ6 344 aa25.86■■□□□ 1.73
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PTPRJ-206ENST00000534219 ST8SIA6P61647 398 aa25.84■■□□□ 1.73
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PTPRJ-206ENST00000534219 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa25.84■■□□□ 1.73
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PTPRJ-206ENST00000534219 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-206ENST00000534219 FSCBQ5H9T9 825 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-206ENST00000534219 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM71AQ8IYT1 594 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-206ENST00000534219 HDDC3Q8N4P3 179 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-206ENST00000534219 TTC17Q96AE7 1141 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-206ENST00000534219 LMLNQ96KR4 655 aa25.82■■□□□ 1.72
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