RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534160.1

GMDS-AS1-212, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CSHL1Q14406 222 aa8.4□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KCNJ12Q14500 433 aa8.4□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.4□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.4□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.4□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.4□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRAM1Q96QH2 718 aa8.4□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RMDN3Q96TC7 470 aa8.4□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.4□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.4□□□□□ -1.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.4□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PIK3C2GO75747 1445 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MAP3K5Q99683 1374 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ASNA1O43681 348 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ITGA5P08648 1049 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RENBPP51606 427 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 COPB1P53618 953 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 P3H1Q32P28 736 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCDC38Q502W7 563 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C4orf46Q504U0 113 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 STYXQ8WUJ0 223 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EPS8L2Q9H6S3 715 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 USP29Q9HBJ7 922 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.39□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DHHO43323 396 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CA12O43570 354 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 USP1O94782 785 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ANXA6P08133 673 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MMP8P22894 467 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRAPPC10P48553 1259 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SEMA3BQ13214 749 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BFSP2Q13515 415 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DNASE1L3Q13609 305 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SLC15A2Q16348 729 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LRFN1Q9P244 771 aa8.38□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KAT6AQ92794 2004 aa8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TCEA3O75764 348 aa8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MT-CO3P00414 261 aa8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CFHR3Q02985 330 aa8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EID2BQ96D98 161 aa8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HS6ST2Q96MM7 605 aa8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DACT1Q9NYF0 836 aa8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 COX11Q9Y6N1 276 aa8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BTBD19C9JJ37 291 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GCATO75600 419 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SERPINF1P36955 418 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 POLE2P56282 527 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GPC5P78333 572 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCDC174Q6PII3 467 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCDC17Q96LX7 622 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 VPS45Q9NRW7 570 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ASIC5Q9NY37 505 aa8.36□□□□□ -1.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ATP7BP35670 1465 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms