RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 BRD8Q9H0E9 1235 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-344P-201ENST00000516635 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-344P-201ENST00000516635 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-344P-201ENST00000516635 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-344P-201ENST00000516635 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCND3Q9UK17 655 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBXO4Q9UKT5 387 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-344P-201ENST00000516635 BTBD3Q9Y2F9 522 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-344P-201ENST00000516635 COMMD10Q9Y6G5 202 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF804BA4D1E1 1349 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTC34A8MYJ7 566 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 PIP5K1CO60331 668 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 UGDHO60701 494 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 CNTN5O94779 1100 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 LYL1P12980 280 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 GRK5P34947 590 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF81P51508 661 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 GHRHRQ02643 423 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 CBFBQ13951 182 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 POSTNQ15063 836 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 PGM5Q15124 567 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 RABEP1Q15276 862 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPS6KA2Q15349 733 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TAF5Q15542 800 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM110CQ1W6H9 321 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 C4orf46Q504U0 113 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF569Q5MCW4 686 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 WDR93Q6P2C0 686 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 SYT13Q7L8C5 426 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 C3orf49Q96BT1 292 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAR2Q96K12 515 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM118BQ9BPY3 351 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 SENP7Q9BQF6 1050 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 HDHD5Q9BXW7 423 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 SEMA4CQ9C0C4 833 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 AAMDCQ9H7C9 122 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPCSQ9HAB8 311 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 NRIP3Q9NQ35 241 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 MTMR4Q9NYA4 1195 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D3EA0A087X179 549 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D3BA6NDS4 549 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 B9A039 149 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D3LB9A6J9 549 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 H0Y3Z8 333 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TCEA3O75764 348 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRT38O76015 456 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 ENO1P06733 434 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 CYP3A4P08684 503 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D3HP0C7X1 549 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPS6KB1P23443 525 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 CPA2P48052 419 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 RCAN1P53805 252 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 B4GALNT1Q00973 533 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TLE3Q04726 772 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 STIM1Q13586 685 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 CUL4BQ13620 913 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 GRAMD1BQ3KR37 738 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTC22Q5TAA0 569 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 MORN5Q5VZ52 161 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 NFRKBQ6P4R8 1299 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 SHC4Q6S5L8 630 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 RTL10Q7L3V2 364 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADGRF4Q8IZF3 695 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 KAT2AQ92830 837 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 EME1Q96AY2 570 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 P2RY11Q96G91 374 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-344P-201ENST00000516635 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms