RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	GCNT1	Q02742	428 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	RING1	Q06587	406 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	STIL	Q15468	1287 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	MPP7	Q5T2T1	576 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	SNX19	Q92543	992 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	AZIN2	Q96A70	460 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	LMLN	Q96KR4	655 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	MTG2	Q9H4K7	406 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	GAREM1	Q9H706	876 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	STIM2	Q9P246	746 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110		A0A1B0GVT2	93 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	BIN1	O00499	593 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	IRAK2	O43187	625 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	CBFA2T3	O75081	653 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	FBXO21	O94952	628 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	PPP1R2	P41236	205 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	GPD2	P43304	727 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	STX17	P56962	302 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	CETN1	Q12798	172 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	KCNH2	Q12809	1159 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	MORC3	Q14149	939 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	HLA-B	Q31612	363 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	MFN1	Q8IWA4	741 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	ADAM32	Q8TC27	787 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	GOLGA1	Q92805	767 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	MYO19	Q96H55	970 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC39A13	Q96H72	371 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	ST7	Q9NRC1	585 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	IGF2R	P11717	2491 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	BICDL2	A1A5D9	508 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	SEMA4F	O95754	770 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	CER1	O95813	267 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF883	P0CG24	379 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	KRT5	P13647	590 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	MATK	P42679	507 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	BECN1	Q14457	450 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	FSCB	Q5H9T9	825 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	TTC17	Q96AE7	1141 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	BIRC7	Q96CA5	298 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	SERPINB11	Q96P15	392 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	FBRS	Q9HAH7	460 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	SUN2	Q9UH99	717 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	NUMA1	Q14980	2115 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	DNTT	P04053	509 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	CSK	P41240	450 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	ZBTB16	Q05516	673 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SNHG4-208	ENST00000514110	NNT	Q13423	1086 aa		12.66	□□□□□ -0.38

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