RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513974.5

RAI14-222, Transcript of retinoic acid induced 14, human

TSL 4

Gene RAI14, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAI14-222	ENST00000513974	DLG4	P78352	724 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	E2F1	Q01094	437 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	RAB41	Q5JT25	222 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	MBLAC2	Q68D91	279 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	GANC	Q8TET4	914 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	USP28	Q96RU2	1077 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	CLMP	Q9H6B4	373 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	EBF2	Q9HAK2	575 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	FZD4	Q9ULV1	537 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	ATM	Q13315	3056 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	PLXNA2	O75051	1894 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	TLR4	O00206	839 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	HLA-DRA	P01903	254 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	NEFL	P07196	543 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	ACP1	P24666	158 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	NXPH1	P58417	271 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	BROX	Q5VW32	411 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	KDM1B	Q8NB78	822 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	DHX58	Q96C10	678 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	LGMN	Q99538	433 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	SPTA1	P02549	2419 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974		B8ZZF3	427 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	PIK3CA	P42336	1068 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	TMPRSS3	P57727	454 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	BNIP3	Q12983	259 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	CST6	Q15828	149 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	PIGZ	Q86VD9	579 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	TTC39C	Q8N584	583 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974	TTC17	Q96AE7	1141 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RAI14-222	ENST00000513974		A0A1W2PP55	124 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	WNT9A	O14904	365 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	MAGEC1	O60732	1142 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	PPP6R2	O75170	966 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	ZBED1	O96006	694 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	ASL	P04424	464 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	SLC8A3	P57103	927 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	ST8SIA6	P61647	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	KCNC4	Q03721	635 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	CUL4A	Q13619	759 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	MYO19	Q96H55	970 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	HIC2	Q96JB3	615 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	SERAC1	Q96JX3	654 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	OMD	Q99983	421 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	PDXK	O00764	312 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	MAPK13	O15264	365 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	MID1	O15344	667 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	ARHGAP6	O43182	974 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	IRAK2	O43187	625 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	SIN3B	O75182	1162 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	MT-CO3	P00414	261 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	C6	P13671	934 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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