RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 ODF1Q14990 250 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 VEPH1Q14D04 833 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 MLC1Q15049 377 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 MAPK6Q16659 721 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM266Q2M3C6 531 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CNPY1Q3B7I2 92 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 GLRX5Q86SX6 157 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D10CQ8IV04 446 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 C12orf56Q8IXR9 622 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 AGAP11Q8TF27 550 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 GATA6Q92908 595 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 OLFM3Q96PB7 478 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PI4K2AQ9BTU6 479 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 NUP85Q9BW27 656 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 TRPV4Q9HBA0 871 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 SETD4Q9NVD3 440 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa4.72□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 FADS2P1A8MWK0 482 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 H7C0C1 242 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 MASP2O00187 686 aa4.71□□□□□ -1.66
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RABGGTB-213ENST00000496055 GHRP10912 638 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
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RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC58Q4VC31 144 aa4.71□□□□□ -1.66
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RABGGTB-213ENST00000496055 SLC6A19Q695T7 634 aa4.71□□□□□ -1.66
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RABGGTB-213ENST00000496055 URGCPQ8TCY9 931 aa4.71□□□□□ -1.66
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RABGGTB-213ENST00000496055 KIFC3Q9BVG8 833 aa4.71□□□□□ -1.66
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RABGGTB-213ENST00000496055 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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RABGGTB-213ENST00000496055 CUL9Q8IWT3 2517 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 ALPK3Q96L96 1907 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 HAS3O00219 553 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 THAP12O43422 761 aa4.71□□□□□ -1.66
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFA2O43678 99 aa4.71□□□□□ -1.66
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